Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms