Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms