Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATL1Q8WXF7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATL1Q8WXF7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms