Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC4Q8WW27 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms