Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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