Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPAS3Q8IXF0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms