Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM198BQ6UWH4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM198BQ6UWH4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms