Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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