Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PDCD1Q15116 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDCD1Q15116 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDCD1Q15116 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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