Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms