Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB40BQ12829 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms