Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms