Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms