Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms