Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIM1P81133 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms