Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERFP50548 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERFP50548 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms