Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms