Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms