Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD27P26842 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms