Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms