Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNAP12004 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNAP12004 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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