Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms