Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms