Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PCH4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PCH4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms