Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms