Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms