Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms