Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3IPQ96QF0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms