Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms