Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms