Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TTC21AQ8NDW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TTC21AQ8NDW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TTC21AQ8NDW8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTC21AQ8NDW8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TTC21AQ8NDW8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TTC21AQ8NDW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TTC21AQ8NDW8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TTC21AQ8NDW8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTC21AQ8NDW8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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