Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HJURPQ8NCD3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms