Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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