Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms