Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms