Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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