Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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