Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms