Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDSNQ15517 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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