Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEA1Q15075 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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