Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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