Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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