Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms