Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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