Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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