Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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