Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms