Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms