Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ACTBP60709 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ACTBP60709 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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ACTBP60709 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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