Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms